Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Opn4Q9QXZ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Opn4Q9QXZ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms