Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc5Q9QX29 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms