Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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