Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlr5Q9JLF7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlr5Q9JLF7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlr5Q9JLF7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlr5Q9JLF7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlr5Q9JLF7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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