Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms