Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms