Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms