Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms