Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms