Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms