Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms