Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod3Q9JHJ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms