Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms