Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc28a3Q9ERH8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms