Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Tspan4Q9DCK3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Tspan4Q9DCK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tspan4Q9DCK3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan4Q9DCK3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tspan4Q9DCK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan4Q9DCK3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan4Q9DCK3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tspan4Q9DCK3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tspan4Q9DCK3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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