Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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