Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms