Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms