Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift43Q9DA69 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift43Q9DA69 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ift43Q9DA69 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ift43Q9DA69 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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