Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms