Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms