Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms