Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn9Q9D805 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn9Q9D805 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn9Q9D805 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn9Q9D805 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn9Q9D805 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms