Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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