Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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