Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms