Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp4cQ9D7F7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms