Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necab3Q9D6J4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms