Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms