Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms