Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms