Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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