Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms