Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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