Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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