Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms