Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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