Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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