Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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