Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chchd1Q9CQA6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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