Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms