Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms