Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms