Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms