Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ubqln4Q99NB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ubqln4Q99NB8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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