Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdca3Q99M54 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca3Q99M54 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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