Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms