Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms