Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms