Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dok4Q99KE3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms